一根毛細管色譜柱的規格描述包括其固定相的種類和內外部尺寸（柱內徑、長度和膜厚等）。不同規格的色譜柱，對樣品的分離結果影響也不盡相同，如樣品分離的洗脫順序、保留時間、分離度和峰形/峰高等。另外，在實際分析應用中，色譜柱的性能指標，如惰性、塔板數和柱流失率等，同樣會嚴重影響到樣品的分離效果。
    毛細管色譜柱的長短直接影響到保留時間和分離效率。實驗室應用的色譜柱長多為5m、7.5m、10m、12.5m、15m、25m、30m、50m、60m、75m、100m和105m等。zen常見的色譜柱長度是30m。
    對于快速分析來說，除了選擇適當的內徑，柱長度也短許多（例如5～15mx0.25mm）。只有這樣，才有可能在zen短的時間內，得到zen佳的分離效果和分析結果。
    如果方法需要改進提高分辨率，較長的色譜柱，如60m或100m，是理想的選擇。分辨率與柱長的平方根成正比。需要注意的是，像一根60m長的色譜柱相對于30m的柱子，其分辨率提高近40%，但分析時間會成倍增長。
    在揮發物的分析應用中，為了改善分離效果，常使用較長的柱型，如50m、60m和100m等。在氣態樣品和精細烴分析應用中，較長色譜柱的使用較為普遍。
    更長的色譜柱會影響柱惰性、柱流失和柱效等多個方面。同時，需要更高的載氣壓力或更換載氣的種類（如把氮氣更換成氫氣/氦氣）。